Neu in das Programm aufgenommene Schulen werden in einer zweijährigen Entwicklungsphase systemisch begleitet. Ein wesentliches Element ist die Fortbildung einer Lehrkraft jeder Programmschule zur Musikkoordinatorin / zum Musikkoordinator. Der Kompetenzgewinn dieser Lehrkraft in fachlicher Hinsicht sowie im Bereich der Prozesssteuerungskompetenz qualifiziert sie für die erfolgreiche Begleitung und Unterstützung des Kollegiums auf dem Entwicklungsweg zur Musikalischen Grundschule. Dabei werden einerseits externe Experten als Fortbildner beauftragt, andererseits unterstützen sich alle am Programm beteiligten Schulen - vor allem im regionalen Verbund ihres Schulamtsbezirkes - auch wechselseitig durch einen engen Ideen- und Erfahrungsaustausch und ggf. durch wechselseitige Fortbildungen. Regelmäßige Sitzungen in regionalen Verbünden und eine alljährliche Fortbildung im Rahmen einer zweitägigen Fachtagung sichern die Fortbildungsaktivität im Netzwerk des Programms Musikalische Grundschule.